文章摘要:藜麦（Chenopodium quinoa Willd.）种质资源的准确鉴别是多样性研究藜麦种业和产业发展的前提和基础。本研究利用MultipSeq多重PCR扩增子捕获技术获得656个SNP，对251份藜麦种质资源进行遗传多样性分析，并利用Perl脚本构建每份种质资源的DNA指纹图谱，基于指纹图谱信息构建个体分子身份证。群体遗传结构分析表明251份种质资源被划分为2个亚群G1和G2，分别对应安第斯高原型藜麦群和智利低海拔型藜麦群；G1、G2 群体遗传多样性指数π值分别为：0.0037和0.0036，群体分化指数Fst值为0.14；群体主成分分析结果与群体遗传结构分析结果完全一致，亚群间存在部分遗传交叉现象；系统发育分析显示G1包括以玻利维亚、秘鲁为主的152份种质资源，G2包括以智利为主的99份种质资源，其中G1亚群又进一步划分为G1-1和G1-2两个亚群，分别对应玻利维亚和秘鲁种质材料，G1-1、G1-2与G2的遗传距离分别为0.068与0.072。112份河北石家庄种质材料中，40份划分到玻利维亚种质群、24份划分到秘鲁种质群、48份划分到智利种质群。本研究构建的251份藜麦种质材料分子身份证能够达到对种质材料溯源和保护的作用，同时群体遗传多样性分析结果对于我国藜麦种质资源划分和系统整理具有一定的参考意义。

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